Freshwater and salt-water influence in human identification by analysis of DNA: an epidemiologic and laboratory study

Aim: To investigate the casuistry of drowning cases by reviewing the records from the Forensic Medicine Institute Nina Rodrigues in the city of Salvador, BA, Brazil, and to verify the potential of DNA recovery in human teeth immersed in water. Methods: An epidemiological survey was conducted followed by a laboratorial phase, in which 40 teeth were immersed in fresh and salt-water, the DNA was extracted by the organic method and amplified by polymerase chain reaction, using the amelogenin as initiator. The electrophoresis initially occurred in agarose gel and later in polyacrylamide gel. Results: In the present survey, 346 deaths from drowning were observed, most of them in salt-water (51.73%), with a predominance of male victims (86.13%) aged from 18 to 35 years-old (37.94%). Dentists identified 14.74% of the victims. DNA was recovered in 37.5% from the samples, most from teeth immersed in freshwater. Polyacrylamide gel analysis in samples that were amplified in agarose gel allowed correct gender identification in 83.3% of the cases. However, allele loss was observed in samples of two victims, jeopardizing gender determination. Conclusions: Dental exposure to water interfered in DNA recovery. The gender investigation using the amelogenin as initiator was effective.

Satellyptus: analysis and database of microsatellites from ESTs of Eucalyptus

The main goal of our research was to search for SSRs in the Eucalyptus EST FORESTs database (using a software for mining SSR-motifs). With this objective, we created a database for cataloging Eucalyptus EST-derived SSRs, and developed a bioinformatics tool, named Satellyptus, for finding and analyzing microsatellites in the Eucalyptus EST database. The search for microsatellites in the FORESTs database containing 71,115 Eucalyptus EST sequences (52.09 Mb) revealed 20,530 SSRs in 15,621 ESTs. The SSR abundance detected on the Eucalyptus ESTs database (29% or one microsatellite every four sequences) is considered very high for plants. Amongst the categories of SSR motifs, the dimeric (37%) and trimeric ones (33%) predominated. The AG/CT motif was the most frequent (35.15%) followed by the trimeric CCG/CGG (12.81%). From a random sample of 1,217 sequences, 343 microsatellites in 265 SSR-containing sequences were identified. Approximately 48% of these ESTs containing microsatellites were homologous to proteins with known biological function. Most of the microsatellites detected in Eucalyptus ESTs were positioned at either the 5 or 3 end. Our next priority involves the design of flanking primers for codominant SSR loci, which could lead to the development of a set of microsatellite-based markers suitable for marker-assisted Eucalyptus breeding programs

Avaliaçäo do emprego de soro humano no meio de Diamond para isolamento e manutençäo de cepas de Trichomonas vaginalis / Evaluation of the use of human serum in Diamond's Medium for the isolation and maintenance of Trichomonas vaginalis

O meio de Diamond vem sendo empregado para o cultivo do Trichomonas vaginalis, Trichomonas tenax e Pentatrichomonas hominis, em sua composiçäo utiliza-se soro de cavalo como fonte de enriquecimento. Neste trabalho, este soro foi substituído pelo soro humano, por facilidade na sua obtençäo em laboratórios de análises clínicas. Os meios de cultura, assim preparados, foram distribuídos em tubos com tampa de rosca, em alíquotas de 8 mL, e os repiques foram feitos a cada 5 dias. As cepas de Trichomonas vaginalis foram inoculadas concomitantemente em meios contendo soro de cavalo e soro humano; resultados satisfatórios foram obtidos no cultivo e manutençäo das cepas, e o número de parasitas dobrou no mesmo período quando foi usado soro humano. Esses dados mostram que o isolamento e a manutençäo desses flagelados podem ser realizados de maneira simples e rotineira nos laboratórios, possibilitando uma melhoria no diagnóstico dessa parasitose e facilidade na manutençäo de cepas para outros estudos.

Characterization of plasmid-related antigen of Yersinia enterocolitica by immunological techniques

Yersínia enterocolitica tem sua virulência relacionada a plasmídeo de 40-48-MDa que codifica proteínas que podem ser expressas nas membranas ou excretadas no meio de cultura. Procurou-se determinar o perfil dessas proteínas em cepas de Y. enterocolitica com e sem o plasmídeo de 40-48-MDa, através de gel de poliacrilamida com SDS (SDS-PAGE). Procurou-se também estudar as condiçöes ótimas de cultura de bactérias para expressäo dessas proteínas e finalmente analisá-las empregando a técnica de Immunoblot e utilizando anti-soro preparado com a amostra com e sem plasmídeo. Esses estudos resultaram na demonstraçäo da ocorrência, entre outros, de uma proteína de 38-kDa, presente apenas na cepa com plasmídeo e que era excretada quando o cultivo era realizado a 37ºC em meio de MOX

Esterilizaçäo de soros e vacinas por radiaçäo gama de cobalto / Sterilization of sera and vaccines by cobalt gamma radiation

Os soros antitetânico, antidiftérico e antibotrópico-crotálico e, ainda, a vacina diftérica-pertussis-tetânica foram submetidos a diferentes intensidades de radiaçäo gama, com os seguintes intuitos: verificaçäo da resistência das atividades específicas destes produtos à açäo dos raios gama; avaliaçäo das possibilidades de utilizaçäo deste tipo de energia radiante para a esterilizaçäo de alguns soros hiperimunes heterólogos e vacinas, mais comumente utilizados em saúde pública. Os resultados obtidos, segundo os parâmetros empregados, mostraram a possiblidade de esterilizaçäo sem alteraçöes das atividades específicas, de ordem biológica ou química, dos produtos experimentados.